1958年10月20日，盐城县盐城人民公社医院正式成立。

    1968年，“盐城人民公社医院”改名为“盐城镇人民医院”。

    1974年，“盐城镇人民医院”改名为“盐城镇卫生院”。

    1983年，“盐城镇卫生院”改名为“盐城市城区人民医院”。

    1988年，盐城市城区编制委员会（1988）26号文，核定医院病床110张，人员为161人。

    1991年，医院职工宿舍楼竣工，建筑面积3200平方米。

    1996年，经市、区编制委员会批准，盐城市城区人民医院集体性质转为全民性质。

    1996年，医院获得国家卫生部颁发的“爱婴医院”称号。

    1997年，新建病房楼交付使用，建筑面积5600平方米，核定床位150张。

    2002年9月，医院实行股份制改革，在城区政府主导参与下，注册了“盐城慈航医院”医院名称，与“城区人民医院”名称并用。

    2003年，区划调整，“城区”更名“亭湖区”，“盐城市城区医院”改名为“盐城市亭湖区人民医院”。

    2013年3月5日，盐城市亭湖区人民医院（东院）启用。

    2020年8月18日，亭湖区人民政府将医院收归公有。